《九重紫》讲述了窦昭这一女主人公重生的故事，以下是详细的故事梗概：
窦昭前世身为窦家嫡女，两岁时失去母亲，父亲续娶继室，她在田庄被放养到十二岁才被接回府，却遭继母百般刁难。后来，她费尽心思嫁给济宁侯，婚姻生活却并不如意，最终劳累一生，郁郁而终。重生后，窦昭回到了小时候，这时母亲还在世，她决定利用先知改变一切，挽救家族的命运。
然而，尽管窦昭努力尝试，却仍未能改变母亲被逼自尽的遗憾。但她没有放弃，而是更加坚定地利用自己的智慧和现代知识，在这个时代中立足并取得成功。她开始学习医术、诗词、绘画等各种技能，并且积极参与社交活动，扩大自己的人脉圈子。在这个过程中，窦昭结识了许多志同道合的朋友，与他们一起合作，共同推动着家族的发展。
与此同时，窦昭也遇到了许多困难和挑战，特别是来自继母的刁难和宅斗。但她凭借着自己的勇气和智慧，一一克服了这些难关。在与继母的斗争中，她收了武馆姐妹为义仆，有了武功高深的护卫，开始谋划独立之路。
一个大雨滂沱的夜晚，窦昭偶遇前世位极人臣却命运多舛的宋墨。她改变了定国公阖族被灭的冤案以及宋墨前世被渣爹陷害、污名除族的下场，从此二人命运紧紧相连。宋墨深陷家变谜团，而窦昭也在继母的破坏下遭遇换亲流言，于是二人选择成亲以结同盟、共度困局。曾经彼此猜忌的他们在相互帮扶中共渡难关，也由此渐渐相知相惜、互为知己。
最终，窦昭与宋墨携手面对危局，共同挽救了家族命运、解开了英国公府换子疑云、成功阻止了辽王（或庆王）谋逆、平定了忠臣冤案、保卫了家国安宁，并找到了属于自己的幸福生活。
整个故事以窦昭的重生经历为主线，展现了她在古代社会中的奋斗与成长，同时也传递了关于亲情、爱情和家国情怀的深刻主题。
