火影忍者504到515集主要讲述的是卡卡西小组接受指派执行某起任务。他们前往了位于邻近火之国边境的神圣之地——托尼卡村，去处理村子里发生的灭村事件。在这个过程中，出现了一些人物，如兜，他出现在托尼卡村，而鸣人为了抓住兜，不惜使出浑身解数，但最后还是让他逃走了。此外，德克带着孩子们逃到了邻近的小村庄里，而幼小的米娜，不知何故常哼出一段神秘的旋律。为了保护托尼卡村的幸存者德克与孩子们，鸣人与小樱便暂住在希赛尔家里。在这个过程中，鸣人与孩子们相处十分融洽，但在此时，鸣人的身体却出现了异状。这些集数中还穿插了一些原创剧情，例如在504-509集，是卡卡西的联队跟忍刀七人众的战斗，这些剧情大部分都是电视动画的原创，漫画里并没有详细的描写。这些集数的设定在动画的第四次忍界大战篇章与龟岛试炼篇章之间，其中510集是力量篇章的开始。此外，关于兜的出场和复制体的解除等设定也与漫画有所不同。
